Rafael Márquez formará parte del cuerpo técnico de Javier Aguirre de acuerdo con la reestructuración del proyecto de México rumbo al Mundial de 2016. Una vez finalizado dicho evento, Márquez asumirá el cargo como director técnico con miras al 2030. De acuerdo con su representante, el ex-futbolista aceptó el acuerdo para ingresar a la Selección Mexicana debido a la negociación de una cláusula multimillonaria en caso de que no se pudiera cumplir con la proyección establecida.

A través de un comunicado en redes sociales, Rafa Márquez anunció su salida oficial del Barcelona y comentó: “Este nuevo reto lo afronto con la responsabilidad que se merecen. Ha sido primero de todo mi orgullo por mi país ante un compromiso tan importante como es jugar un mundial en casa y el otro poder transmitir todos mis conocimientos, mis valores y mi pasión por el futbol a todos los que formaremos parte de esta nueva etapa”. La presentación oficial tanto de Márquez como de Aguirre, será el próximo 1 de agosto.